碇真嗣的母親名為綾波唯（在舊版里名為碇唯，碇源渡原名六分儀源渡，是入贅之后改姓的。）在他還很小的時候就死了。

　　以碇真嗣當時的年紀大概已經忘記了，實際上他見過母親出事的場景，最初的EVA初號機控制系統計劃采用的是直接插入S2機關的方式（在新劇場版中，初號機一開始就擁有S2機關，只是NERV輕易無法啟動這個核心罷了），這一系統的發明者正是綾波唯，同時也自愿成為第一個實驗對象。

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