姚廣孝、解縉、楊士奇等人制造出這兩次意外，都沒有留下證據。即便朱棣讓馬三寶徹查，也會查不到任何東西。他們很清楚地知道，要是讓朱棣知道這兩次意外都是他們所為。以朱棣對徐儀華的在意程度，一定會取他們性命，所以他們決定把這些秘密爛在肚子里。
徐儀華沒精打采地說：“芍藥，你把這些飯菜都拿出去，我不想吃。”芍藥為難地說：“小姐，你多少都要吃一點。你已經有好些天沒有吃東西，再是這樣下去你的身體還怎么受得了。”徐儀華沒有說話，默默把頭轉到一邊，不再理會芍藥。芍藥坐到床邊，握著徐儀華的手，說：“小姐，奴婢知道失去這個孩子，你一定很傷心、難過，可是你不能不愛惜自己的身體，這樣王爺會很傷心的。”見芍藥提起朱棣，徐儀華把臉轉過來。
徐儀華問芍藥朱棣怎么樣？芍藥說這些天朱棣為了追查兇手，都沒有好好休息，整個人消瘦了不少。聽見芍藥這樣說，徐儀華眼泛淚光。芍藥借機勸說幾句，徐儀華終于肯吃東西。朱棣到房間探望徐儀華，徐儀華看到朱棣憔悴的樣子，心里面覺得很心痛。徐儀華用手撫摸朱棣的臉，哭著說：“王爺，都是我不好，是我沒有能力保護我們的孩子。你本來就事務繁多，現在又要追查殺害孩子的兇手，我真的覺得自己很沒用。”
朱棣把徐儀華擁進懷里，安慰地說：“儀華，你不要這樣說自己。我從來都沒有覺得你沒用，相反你一直幫了我很多。正因為有你在，我才能去做我想做的事情。至于孩子的事情，這更加不是你的錯，是有人蓄意謀害，你不需要責怪自己。”朱棣說完之后，徐儀華哭得更加厲害。一會兒之后，朱棣放開徐儀華，用手為她擦眼淚。
徐儀華問朱棣追查得怎么樣？朱棣說馬三寶那里沒有查出任何東西。朱棣冷冷地說：“自從謝貴和張信掌到了北平之后，你就接二連三出事，這讓我不得不懷疑。徐儀華不可置信地問：“謝貴和張信掌是奉命來到北平，難道是允炆讓他們這樣做的？”朱棣咬牙切齒地說：“雖然三寶查不出任何東西，但是這不代表他們沒有嫌疑。”
徐儀華激動地說：“他們為什么要這樣做？這只是一個孩子，為什么他們不能放過？”朱棣冷哼一聲，說：“他們是允炆的臣子，自然要唯命是從，他們根本不會管這是大人還是孩子。以前是我太重情義，從今以后我不會再對允炆有任何幻想。既然允炆不給我活路，我也不會對他有一絲憐憫。”說到最后，朱棣的臉上怒目圓瞪。
徐儀華知道，朱棣已經決定謀反。徐儀華握著朱棣的手，溫柔地說：“王爺，無論你做什么決定，我都會支持你。你安心去做你想做的事情，其他事情我會處理好。你不需要擔心我和三個孩子，我們會照顧好自己。”聽到徐儀華這樣說，朱棣的心里面覺得很感動，他把徐儀華緊緊擁進懷里。
朱棣就到書房，與姚廣孝、解縉、楊士奇等人商量造反事宜。朱棣想著把謝貴、張信掌誘到燕王府殺死，一泄心頭之恨。朱棣讓馬三寶傳遞消息，說自己因為徐儀華滑胎變得瘋瘋癲癲。馬三寶把這個消息傳遍北平，謝貴、張信掌聽到之后，就第一時間到燕王府。謝貴、張信掌看到朱棣瘋瘋癲癲，再聽到徐儀華在一旁淚如雨下地訴說，他們都信以為真。
謝貴、張信掌寬慰徐儀華幾句，就離開燕王府，朱棣知道自己的第一步已經成功。朱棣讓人秘密到應天府，把一些文臣武將收為己用。這些文臣武將都是不滿明惠帝朱允炆，覺得他沒有為明朝立下任何汗馬功勞，根本沒有資格登基為帝。除此之外，朱棣又招降一些蒙古士兵，以擴充自己的軍隊。
齊泰無意中得知朱棣的部下鄧庸到應天府辦事，讓人逮捕鄧庸。經過一番審訊，齊泰從鄧庸身上得到朱棣謀反的證據，齊泰把所得的證據呈交給明惠帝朱允炆。明惠帝朱允炆看到之后龍顏大怒，他不明白為什么對明太祖朱元璋許諾會效忠自己的朱棣會謀反。明惠帝朱允炆下旨把朱棣的親屬逮捕到應天府，并且命張信逮捕朱棣。
張信表面上是明惠帝朱允炆的臣子，但是已經投靠朱棣。朱棣覺得事情已經迫在眉睫，于是就擒殺謝貴、張信掌，并且命張玉、?朱能率軍攻克北平九門，把北平收歸己有。朱棣向鄰近的幾個州縣發動軍事進攻，借口要清除朝廷里面的奸佞之徒。朱棣讓姚廣孝、解縉、楊士奇等人精心策劃幾篇檄文，這幾篇檄文都在說朱棣正在進行終止內亂的正義行動。
無論是儒家崇尚的孝道，還是規定諸王義務的《祖訓錄》，他的行為都是正確的。朱棣指責明惠帝朱允炆毀壞明太祖朱元璋的寢宮，背棄明太祖朱元璋對的遺訓。朱棣還指責明惠帝朱允炆受黃子澄、齊泰、方孝孺的蠱惑，對諸王進行迫害。朱棣控訴明惠帝朱允炆讓謝貴、張信掌傷害徐儀華和腹中胎兒，逼得他不得不起兵謀反。
朱棣覺得自己是正當防衛，他要求明惠帝朱允炆除掉黃子澄、齊泰、方孝孺，恢復明太祖朱元璋的法律和制度。朱棣聲稱，因為自己是諸王之首，有義務執行這次的懲戒。朱棣在檄文里面盟誓，自己并沒有想要做皇帝，只是尊崇《祖訓錄》中的規定，清除朝廷之中的奸佞之徒。
這幾篇檄文一出，讓北平的百姓對朱棣表示深深的同情，同時對明惠帝朱允炆厭惡至極。這讓朱棣的謀反立得住腳，也幫助他集結到可以對抗朝廷的人馬。徐儀華為朱棣穿上盔甲，穿戴完畢之后朱棣握著徐儀華的手，調笑地說：“儀華，現在的我是不是比任何時候都要英氣逼人？”徐儀華微微一笑，說：“王爺，無論是什么時候，你在我的心目中永遠都是這么英氣逼人。”徐儀華說完就一臉癡迷地看著朱棣。
朱棣用手撫摸徐儀華的臉，溫柔地說：“幫我好好守著北平，等我凱旋而歸。”徐儀華握著朱棣放在自己臉上的手，用側臉蹭朱棣的手心，點了點頭。朱棣深深看了徐儀華一眼，隨后就轉身離開。朱棣誓師對抗朝廷下諭將士，打著“清君側”的旗號起兵“靖難”，至此與朝廷的軍事對峙就此開始。
戰事之初，因為朱棣在北方經營頗久，北方諸將大部分都是朱棣舊部，投降朱棣的將士甚多，很快朱棣就攻下通州、薊州、懷柔等城。明惠帝朱允炆封耿炳文為大將軍，率軍三十萬討伐朱棣。耿炳文派一支九千人的先鋒軍抵達雄縣（今HEB省BD市雄縣），但是受到朱棣的偷襲，九千人全部戰死。其后耿炳文與朱棣在正定相遇（今HEB省SJZ市正定縣），最終被朱棣打敗。
明惠帝朱允炆以李景隆代替耿炳文，率領五十萬大軍圍攻北平。朱棣親自率領精偷襲大寧，抓住寧王朱權和妻妾、孩子，并且得到朵顏三衛騎兵，軍力瞬間驟增。朱高熾收到李景隆率領五十萬大軍圍攻北平的消息，就立即找徐儀華商量。
徐儀華平靜地說：“李景隆缺乏計謀又驕傲自負，外表強硬但是內心缺乏勇氣，刻薄善妒卻又不肯接受別人的意見。但是畢竟李景隆是一個將軍，不是這么容易對付。如今他奉命圍攻北平，我們只能堅守，千萬不能出城迎擊。”徐儀華隨即下令撤去盧溝橋的守軍，裝作毫不設防的樣子，以誘使李景隆的軍隊長驅直入。不得不說徐儀華的這個計謀設想得很周密，但是同時也很冒險。