隆慶三年白圭奠定內閣地位的一戰，主要目標是玄蘊谷。

　　玄蘊谷原為一處桃花源式的聚所，居民的方言與官話不相通。其谷中有巨樹，蜀人稱之為“冥靈”。在神玉發現以前，玄蘊谷人以冥靈樹為生，以道觀為掩護，在樹上修建了各樣的道觀，建立了屬于自己的文化傳承。

　　冥靈果是神玉的來源，冥靈果的果肉結晶，與神玉具有相同的性質，因而被視為神玉。玄蘊谷人依靠冥靈樹果建立了靈法文化，而白圭在機械化初期，所需求的全部神玉也都購進自玄蘊谷。

　　漸漸地，玄蘊谷人在靈法文明的未來上與白圭、利奇一黨產生了分歧。白圭希望建設一個先進的機械化文明，而玄蘊谷人希望把玄蘊谷的靈法文明附加在大明的未來。

　　玄蘊谷人在京師發動兵變，企圖除掉隆慶朝廷和白圭內閣，但兵變迅速被白圭鎮壓。此后，白圭和隆慶帝迅速認識到了事情的嚴重性，隨即對玄蘊谷展開了大規模“平靖”（即屠殺），玄蘊谷瞬間失去了在明朝玄蘊谷外的所有勢力。

　　此事謂之“冥靈案”。

　　后記：白圭設五城十二樓，其中設立成都神機城用來監視玄蘊谷，但玄蘊谷勢力極大，難以壓制，最終反而控制了整個成都神機城。但由于西南長云衛的駐軍，玄蘊谷始終不能將勢力擴展出川。這種尷尬的情況，不論是四大刑衙還是機械化軍隊“王畿六師”，都束手無策，甚至不愿意提起。